Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Clk2O35491 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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