Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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MttpO08601 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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MttpO08601 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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MttpO08601 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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MttpO08601 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MttpO08601 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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MttpO08601 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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MttpO08601 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MttpO08601 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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