Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MsmbO08540 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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