Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna2d1O08532 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna2d1O08532 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d1O08532 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms