Protein–RNA interactions for Protein: K9J7H2

Gm4141, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4141K9J7H2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm4141K9J7H2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm4141K9J7H2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms