Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm379J3QQ19 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm379J3QQ19 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm379J3QQ19 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm379J3QQ19 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gm379J3QQ19 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm379J3QQ19 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm379J3QQ19 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm379J3QQ19 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm379J3QQ19 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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