Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Alkal1J3QPP8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Alkal1J3QPP8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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