Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm933J3QPC1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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