Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3415J3QMS8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3415J3QMS8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3415J3QMS8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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