Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lipo1J3QME6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms