Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms