Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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