Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17535J3KMR8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17535J3KMR8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17535J3KMR8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17535J3KMR8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17535J3KMR8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17535J3KMR8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17535J3KMR8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17535J3KMR8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17535J3KMR8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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