Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms