Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm20517G3UVU6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20517G3UVU6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms