Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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