Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1C7

Gm10471, Predicted gene 10471, mousemouse

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Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10471E9Q1C7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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Gm10471E9Q1C7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10471E9Q1C7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Gm10471E9Q1C7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Gm10471E9Q1C7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Gm10471E9Q1C7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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Gm10471E9Q1C7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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Gm10471E9Q1C7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10471E9Q1C7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms