Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms