Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms