Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rfx8D3YU81 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rfx8D3YU81 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rfx8D3YU81 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rfx8D3YU81 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rfx8D3YU81 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rfx8D3YU81 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms