Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rrn3B2RS91 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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