Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms