Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf3B2KF05 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms