Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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