Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6880A3KG45 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms