Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttll9A2APC3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttll9A2APC3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 985.4 ms