Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc183A2AJB1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc183A2AJB1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms