Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms