Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms