Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms