Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms