Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod3Q9R0E1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms