Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Col4a4Q9QZR9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col4a4Q9QZR9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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