Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChmlQ9QZD5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms