Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms