Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms