Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnip3Q9QXT8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Kcnip3Q9QXT8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms