Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpsf3Q9QXK7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpsf3Q9QXK7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms