Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Csnk1eQ9JMK2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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