Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rabgef1Q9JM13 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rabgef1Q9JM13 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rabgef1Q9JM13 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rabgef1Q9JM13 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rabgef1Q9JM13 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rabgef1Q9JM13 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rabgef1Q9JM13 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rabgef1Q9JM13 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rabgef1Q9JM13 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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