Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkd2l2Q9JLG4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms