Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pole3Q9JKP7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms