Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim39Q9ESN2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim39Q9ESN2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms