Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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