Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Taf8Q9EQH4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Taf8Q9EQH4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf8Q9EQH4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Taf8Q9EQH4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf8Q9EQH4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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