Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf6Q9DBU5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf6Q9DBU5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms