Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ftsj3Q9DBE9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms