Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl40Q9D783 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms