Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc94Q9D6J3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms