Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc9bQ9D6E4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ttc9bQ9D6E4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ttc9bQ9D6E4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ttc9bQ9D6E4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ttc9bQ9D6E4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ttc9bQ9D6E4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ttc9bQ9D6E4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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